പതനം
നാറ്റ് മെഡൽ | സംയോജിത ട്യൂമർ, അവ്യക്തമായ ക്യാൻസർ, രോഗപ്രതിരോധം, മൈക്രോബയൽ ലാൻഡ്സ്കേപ്പ് എന്നിവ മാപ്പുചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു മൾട്ടി -വിക്സ് സമീപനം, രോഗപ്രതിരോധ സംവിധാനമായ മൈക്രോബൈയോമിന്റെ ഇടപെടൽ വെളിപ്പെടുത്തുന്നു
പ്രാഥമിക വൻകുടൽ കാൻസറിനായുള്ള ബയോർക്കർമാർ സമീപ വർഷങ്ങളിൽ വ്യാപകമായി പഠിച്ചിട്ടുണ്ടെങ്കിലും, നിലവിലെ ക്ലിനിക്കൽ മാർഗ്ഗനിർദ്ദേശങ്ങൾ അവ്യക്തമാണ് ജീൻ ആശ്ചര്യകരമായി രോഗപ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ, മൈക്രോബയൽ പ്രൊഫൈലുകൾ, ട്യൂമർ സ്ട്രോമ എന്നിവ തമ്മിലുള്ള സഹപാഠിക ഇല്ലാത്തത് ഗവേഷകർ ശ്രദ്ധിച്ചിട്ടുണ്ട്, കാൻസർ ജെറക്ടർ സ്ട്രോമ കോഹോക്ടറൽ കാൻസർ കോഹോക്ടർ ക്യാൻസർ, രോഗി അതിജീവനം.
റിസർച്ച്, കാൻസർ സെല്ലുലാർ, ക്യാൻസർ, ക്യാൻസൽ ക്യാൻസറിന്റെ സവിശേഷതകൾ ക്യാൻസറിന്റെ സെല്ലുലാർ, ക്യാൻസൽ സവിശേഷതകളുടെ തെളിവുകൾ ക്ലിനിക്കൽ ഫലങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, പക്ഷേ അവരുടെ ഇടപെടലുകൾ രോഗിയെ എങ്ങനെ ബാധിക്കുന്നു എന്നതിനെക്കുറിച്ച് ഇപ്പോഴും പരിമിതമായ ധാരണയുണ്ട്.
ഫിനോട്ടിപ്പിക് സങ്കീർണ്ണതയും ഫലവും തമ്മിലുള്ള ബന്ധം വിച്ഛേദിക്കാൻ, ഖത്തറിലെ സിദ്ര ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് ഓഫ് മെഡിക്കൽ റിസർച്ചിൽ നിന്നുള്ള ഗവേഷകരുടെ സംഘം അടുത്തിടെ ഒരു സംയോജിത സ്കോർ (മൈക്രോസ്കോറർ) തിരിച്ചറിഞ്ഞു, അത് ഒരു കൂട്ടം രോഗികളെയും ആകർഷിക്കുന്ന ഒരു കൂട്ടം രോഗികളെയും സംയോജിപ്പിച്ച് (ഐസിആർ) തിരിച്ചറിയുന്നു. മുഴകൾ, മൊത്തത്തിൽ പ്രവർത്തിക്കുന്ന, ഡീപ് ബാക്ടീരിയൽ ടിഷ്യു എന്നിവ ഉൾപ്പെടെ 348 രോഗികളുടെ സമഗ്രമായ ഒരു ജനസംഖ്യയാണ് ടീം അവതരിപ്പിച്ചത്. പ്രകൃതി മെഡിസിൻ പ്രസവ വൈദ്യത്തിൽ പ്രകൃതി മെഡിസിനായി പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു "വൻകുടൽ കാൻസറിലെ ഒരു സംയോജിത ട്യൂമർ, രോഗപ്രതിരോധ, മൈക്രോബോം അറ്റ്ലസ്" എന്നാണ്.
പ്രകൃതി മെഡിസിനിൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ച ലേഖനം
Ac-icam അവലോകനം
വ്യവസ്ഥാപരമായ തെറാപ്പി ഇല്ലാത്ത രോഗികളിൽ നിന്ന് പുതിയ ശീതീകരിച്ച ട്യൂമർ സാമ്പിളുകൾ വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിൽ ഗവേഷകർ ഒരു ഓർത്തോഗണൽ ജെനോമിക് പ്ലാറ്റ്ഫോം ഉപയോഗിച്ചു. മൊത്തത്തിലുള്ള മുഴുവൻ സീക്വൻസിംഗ് (ഡബ്ല്യുഇഎസ്), ആർഎൻഎ-സെക്യു ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം, ആർഎൻഎ-സെക് ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം എന്നിവ അടിസ്ഥാനമാക്കി, 348 രോഗികളിൽ നിന്നുള്ള ജനീതാവായി ഡാറ്റ നിലനിർത്തുകയും 4.6 വർഷം ഒരു മീഡിയൻ ഫോളോ-അപ്പ് ഉപയോഗിച്ച് ഡ down ൺസ്ട്രീം വിശകലനത്തിനായി ഉപയോഗിക്കുകയും ചെയ്തു. റിസോഴ്സ് ടീം ഈ റിസോഴ്സ് സിദ്ര-ലംസി അസി-ഇക്കാലം എന്ന് പേരിട്ടു: രോഗപ്രതിരോധ-കാൻസർ-മൈക്രോബൈയോം ഇടപെടലിലേക്കുള്ള മാപ്പ്, ഗൈഡ് (ചിത്രം 1).
ഐസിആർ ഉപയോഗിച്ചുള്ള തന്മാത്ലാർ വർഗ്ഗീകരണം
നിരന്തരമായ ക്രോസർ (ഐസിആർ) എന്ന് വിളിക്കുന്ന നിരന്തരമായ ക്രോസർ ഇമ്യൂണൻസർവിലേഷന് മോഡുലാർ സെൻറ്റിക് മാർക്കറുകളുടെ ഒരു മോഡുലാർ സെറ്റ് ക്യാപ്ചർ ചെയ്യുന്നു, മെലനോമ, മൂത്രസഞ്ചി അർബുദം, സ്തനാർബുദം എന്നിവ ഉൾപ്പെടെ 20 ജീൻ പാനലിലേക്ക് ഇത് ഐസിആർ ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്തു. സ്തനാർബുദം ഉൾപ്പെടെയുള്ള പലതരം കാൻസർ തരങ്ങൾക്കിടയിലെ ഇമ്മ്യൂണോതെറാപ്പിയുമായി ഐസിആർ ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു.
ആദ്യം, ഗവേഷകർ മൂന്ന് ക്ലസ്റ്ററുകളായി സംവദിക്കാൻ ഐസിആർ ജീൻ (ഹോട്ട് ട്യൂമറുകൾ), ഹൈക്കോടതി ഐസിആർ, മീഡിയം ഐസിആർ, കുറഞ്ഞ ഐസിആർ (കോൾഡ് ട്യൂസർമാർ) (ചിത്രം 1 ബി) എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് ഗവേഷകർ സാധൂകരിച്ചു. കോളൻ ക്യാൻസറിനെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സമവായ തന്മാത്തരണ ഉപവല്യങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട രോഗപ്രതിരോധ പ്രവണതയെ ഗവേഷകർ സ്വീകരിക്കുന്നു. സിഎംഎസ് വിഭാഗങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട് CMS1 / IREMUNGE, CMS2 / കാനോണിക്കൽ, CMS3 / മെറ്റബോളിക്, CMS4 / MESCHENCHYMAL എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു. എല്ലാ സിഎംഎസ് ഉപരേഖകളിലെയും എല്ലാ സിഎംഎസ് സബ്തുറ്റുകളിലും ഐസിആർ സ്കോറുകൾ നെഗറ്റീവ് ആയി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, സിഎംഎസ് 4 മുഴകളിൽ മാത്രമേ നിരീക്ഷിക്കപ്പെടുകയുള്ളൂ.
എല്ലാ സിഎംഎസിലും, പ്രകൃതിദത്ത കൊലയാളിയുടെ (എൻകെ) സെൽ സെൽ, ടി സെൽ സെൽ സെൽ, ടി സെൽ സെൽസെറ്റുകൾ എന്നിവയാണ് ഏറ്റവും കൂടുതൽ വേരിയബിളിൽ ഏറ്റവും കൂടുതൽ.
ചിത്രം 1. എസി-ഇക്കാം സ്റ്റഡി രൂപകൽപ്പന, രോഗപ്രതിരോധവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീൻ ഒപ്പ്, രോഗപ്രതിരോധം, തന്മാത്രുക്കൾ എന്നിവയും അതിജീവനവും.
ട്യൂമർ-സമ്പുഷ്ടമായി, ക്ലോണലി ആംപ്ലിഫൈഡ് ടി സെല്ലുകൾ ഐസിആർ പിടിച്ചെടുക്കുന്നു
ട്യൂമർ ടിഷ്യു നുഴഞ്ഞുകയറുന്ന ടി സെല്ലുകൾ മാത്രം ട്യൂമർ ആന്റിജനുകൾക്കായി പ്രത്യേകമായി റിപ്പോർട്ടുചെയ്യുന്നു (10% ൽ താഴെ). അതിനാൽ, അന്തർവാഹക ടി സെല്ലുകളിൽ ഭൂരിഭാഗവും ബൈസ്റ്റാർഡർ ടി സെല്ലുകൾ (ബൈസ്റ്റാർഡർ ടി സെല്ലുകൾ) എന്നാണ് വിളിക്കുന്നത്. ഉൽപാദനപരമായ ടിസിആർ ഉള്ള പരമ്പരാഗത ടി സെല്ലുകളുടെ എണ്ണമുള്ള ഏറ്റവും ശക്തമായ പരസ്പര ബന്ധം (ആർഎൻഎ-സെക്യു കണ്ടെത്തി) ല്യൂക്കോസൈറ്റ് ഉപവിഭാഗം) നിരീക്ഷിച്ചു, അത് ടി സെൽ ഉപ-സെക്യുവിനെ കണക്കാക്കാൻ കഴിയും (ചിത്രം 2 എ) ഐസിആർ ക്ലസ്റ്ററുകളിൽ (മൊത്തത്തിലും സിഎംഎസ് ക്ലാസിഫിക്കേഷന്റെയും ഏറ്റവും കൂടുതൽ ക്ലോസലിലെ ഏറ്റവും കൂടുതൽ ക്ലോസലിറ്റി ഐസിആർ-ഉയർന്ന, സിഎംഎസ് സബ്ടൈപ്പ് സിഎംഎസ് 1 / രോഗപ്രതിരോധ ഗ്രൂപ്പുകളിൽ (ചിത്രം 2 സി) നിരീക്ഷിച്ചു. മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം (18,270 ജീനുകൾ), ആറ് ഐസിആർ ജീനുകൾ (ഐഎഫ്ആർ, ഇഎഫ്ആർഎഫ്, ഇആർഎഫ് 1, സിസിഎൽ, സിഎസിസി 10, സി.എസിസിഎൽ 10, സിഎസിസിഎൽ 10) എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു (ചിത്രം 2 ഡി). ട്യൂമർ-റെസ്റ്റോൺ സിഡി 8 മാർക്കറുകൾ (ചിത്രം 2 എഫ്, 2 ജി) ഉപയോഗിച്ച് നിരീക്ഷിച്ച പരസ്പര ബന്ധത്തേക്കാൾ കൂടുതൽ ഐസിആർ ജീനുകളുമായി ഇമ്യൂണോസക് ടിസിആർ ക്ലോണലി കൂടുതൽ ശക്തമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ഉപസംഹാരമായി, ഐസിആർ ഒപ്പ് ട്യൂമർ-സമ്പുഷ്ട്യം, ക്ലോണലായി ആംപ്ലിഫൈഡ് ടി സെല്ലുകൾ എന്നിവയുടെ സാന്നിധ്യം പകർത്തുന്നുണ്ടെന്ന് മുകളിൽ പറഞ്ഞ വിശകലനം സൂചിപ്പിക്കുന്നു, മാത്രമല്ല അതിന്റെ പ്രോഗ്നോസ്റ്റിക് പ്രത്യാഘാതങ്ങൾ വിശദീകരിക്കുകയും ചെയ്യാം.
ചിത്രം 2. രോഗപ്രതിരോധവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഉല്പങ്ങൾ, രോഗപ്രതിരോധം, മോളിക്യുലർ ഉപവിഭാഗം എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് ടിസിആർ അളവുകളും പരസ്പര ബന്ധവും.
ആരോഗ്യമുള്ളതും വൻകുടൽ കാൻസർ ടിഷ്യുകളിൽ സൂക്ഷ്മനിത രചന
പൊരുത്തപ്പെടുന്ന ട്യൂമർ, 246 രോഗികളിൽ നിന്നുള്ള ആരോഗ്യമുള്ള വൻ കോളൻ ടിഷ്യു എന്നിവയിൽ നിന്ന് വേർതിരിച്ചെടുത്തത് ഗവേഷകർ 16 സെ ആർ ആർഎ സീക്വൻസി അവതരിപ്പിച്ചു (ചിത്രം 3 എ). മൂല്യനിർണ്ണയത്തിന് അനുയോജ്യമായ 42 ട്യൂമർ സാമ്പിളുകളിൽ നിന്ന് 16 സെ ആദ്യം, ഗവേഷകർ പൊരുത്തപ്പെടുന്ന മുഴകൾക്കും ആരോഗ്യമുള്ള കോളൻ ടിഷ്യുവിനും ഇടയിലുള്ള ആപേക്ഷിക സമൃദ്ധിയെ താരതമ്യം ചെയ്തു. ആരോഗ്യമുള്ള സാമ്പിളുകളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ ട്യൂമറുകളിൽ ക്ലോസ്ട്രിഡിയം പെർഷിൻസ് ഗണ്യമായി വർദ്ധിച്ചു (ചിത്രം 3A-3D). ട്യൂമർ, ആരോഗ്യകരമായ സാമ്പിളുകൾക്കിടയിൽ ആൽഫ വൈവിധ്യം (ഒരൊറ്റ സാമ്പിളിലെ വൈവിധ്യവും സമൃദ്ധിയും) ഐസിആർ-ലോ ടുറേഴ്സുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഐസിആർ-ഉയർന്ന മുമ്യങ്ങളിൽ നിരീക്ഷിച്ചു.
സൂക്ഷ്മപരിശോധനകൾക്കും ക്ലിനിക്കൽ ഫലങ്ങൾക്കും ഇടയിൽ ചികിത്സിക്കൽ പ്രസക്തമായ അസോസിയേഷനുകൾ കണ്ടെത്തുന്നതിന്, അതിജീവനത്തെ പ്രവചിക്കുന്ന മൈക്രോബൈയോം സവിശേഷതകൾ തിരിച്ചറിയാൻ 16 സെ ആർ ആർ സീക്വിസ്റ്റുചെയ്യുന്ന ഡാറ്റ കണ്ടെത്തുന്നതിനാണ് ഗവേഷകർ ലക്ഷ്യമിടുന്നത്. എസി-ഇക്കാം 246 ൽ, ഗവേഷകർ ഒരു ഓസ് കോക്സ് റിഗ്രഷൻ മോഡലാക്കി.
ഈ പരിശീലനത്തിൽ COHORT (ICAM246), കുറഞ്ഞ എംബിആർ സ്കോർ (MBAM246) (MBAM246) (MBAM246) മരണ സാധ്യത (85%) കാര്യമായ അപകടസാധ്യതയുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. സ്വതന്ത്രമായി സാധൂകരിക്കുന്ന രണ്ട് കോഹോർട്ടുകളിൽ (ICAM42, TCGA COAD) എന്നിവയിൽ കുറഞ്ഞ എംബിആർ (റിസ്ക്), നീണ്ടുനിൽക്കുന്ന ഒ.എസ് എന്നിവ തമ്മിലുള്ള അസോസിയേഷൻ ഗവേഷകർ സ്ഥിരീകരിച്ചു. .
ചിത്രം 3. ട്യൂമർ, ആരോഗ്യകരമായ ടിഷ്യൂകൾ, ഐസിആർ, രോഗി എന്നിവയുമായുള്ള ബന്ധം.
തീരുമാനം
ഈ പഠനത്തിൽ ഉപയോഗിച്ച മൾട്ടി-ഒവിക്സ് സമീപനം, കോളക്ടൽ ക്യാൻസറിലെ രോഗപ്രതിരോധ പ്രതികരണത്തിന്റെ തന്മാത്രിക ഒപ്പിന്റെ സമഗ്രവും വിശകലനവും പ്രാധാന്യമുള്ളതും മൈക്രോബയോം, രോഗപ്രതിരോധ ശേഷിയും തമ്മിലുള്ള ഇടപെടൽ വെളിപ്പെടുത്തുന്നു. ട്യൂമർ, ആരോഗ്യകരമായ ടിഷ്യുകൾ എന്നിവയുടെ ഡീപ് സീക്യറിംഗ് ട്യൂൺസ് ട്രോക്ക് ചെയ്യുന്നത് വെളിപ്പെടുത്തി, ട്യൂമർ ധീരരായതും ട്യൂമർ-നിർദ്ദിഷ്ട ടി സെൽ ക്ലോണുകളുടെയും പിടിച്ചെടുക്കാനുള്ള കഴിവ് കാരണം.
എസി-ഇക്കാം സാമ്പിളുകളിൽ 16 എസ് ആർആർഎ ജീനിംഗ് ഉപയോഗിച്ച് ട്യൂമർ മൈക്രോബേം രചന ഉപയോഗിച്ച്, ശക്തമായ പ്രോഗ്നോസ്റ്റിക് മൂല്യമുള്ള ഒരു മൈക്രോബയോം സിഗ്നേച്ചർ (എംബിആർ റിസ്ക് സ്കോർ) ടീം തിരിച്ചറിഞ്ഞു. ട്യൂമർ സാമ്പിളുകളിൽ നിന്നാണ് ഈ ഒപ്പ് ലഭിച്ചതെങ്കിലും ആരോഗ്യമുള്ള കോളക്ലിം, ട്യൂമർ എംബിആർ റിസ്ക് സ്കോർ എന്നിവയ്ക്കിടയിൽ ശക്തമായ പരസ്പര ബന്ധമുണ്ടായിരുന്നു, ഈ ഒപ്പ് രോഗികളുടെ കുത്ത് മൈക്രോബയോം ഘടന പകർത്താൻ നിർദ്ദേശിച്ചു. ഐസിആർ, എംബിആർ സ്കോറുകൾ സംയോജിപ്പിച്ച്, വൻകുടൽ കാൻസർ രോഗികളിൽ അതിജീവനം പ്രവചിക്കുന്ന ഒരു മൾട്ടി-ഒമിക് വിദ്യാർത്ഥി ബയോമാർക്കറെ തിരിച്ചറിയാനും സാധൂകരിക്കാനും കഴിയും. വൻകുടൽ ബയോളജിയെ നന്നായി മനസിലാക്കാൻ പഠനത്തിന്റെ മൾട്ടി-ഒമിക് ഡാറ്റാസെറ്റ് ഒരു വിഭവം നൽകുന്നു, വ്യക്തിഗതമാക്കിയ ചികിത്സാ സമീപനങ്ങളെ കണ്ടെത്താൻ സഹായിക്കുന്നു.
പോസ്റ്റ് സമയം: ജൂൺ -15-2023
സ്വകാര്യത ക്രമീകരണങ്ങൾ