നാറ്റ് മെഡ് | സംയോജിത ട്യൂമർ മാപ്പിംഗ് ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു മൾട്ടി-ഓമിക്സ് സമീപനം.

നാറ്റ് മെഡ് | കൊളോറെക്ടൽ കാൻസറിന്റെ സംയോജിത ട്യൂമർ, രോഗപ്രതിരോധം, സൂക്ഷ്മജീവ ലാൻഡ്‌സ്കേപ്പ് എന്നിവ മാപ്പ് ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഒരു മൾട്ടി-ഓമിക്സ് സമീപനം, രോഗപ്രതിരോധ സംവിധാനവുമായുള്ള സൂക്ഷ്മജീവിയുടെ പ്രതിപ്രവർത്തനം വെളിപ്പെടുത്തുന്നു.
പ്രാഥമിക വൻകുടൽ കാൻസറിനുള്ള ബയോമാർക്കറുകൾ സമീപ വർഷങ്ങളിൽ വ്യാപകമായി പഠിച്ചിട്ടുണ്ടെങ്കിലും, നിലവിലെ ക്ലിനിക്കൽ മാർഗ്ഗനിർദ്ദേശങ്ങൾ ചികിത്സാ ശുപാർശകൾ നിർണ്ണയിക്കുന്നതിന് ട്യൂമർ-ലിംഫ് നോഡ്-മെറ്റാസ്റ്റാസിസ് സ്റ്റേജിംഗ്, ഡിഎൻഎ പൊരുത്തക്കേട് നന്നാക്കൽ (എംഎംആർ) വൈകല്യങ്ങൾ അല്ലെങ്കിൽ മൈക്രോസാറ്റലൈറ്റ് അസ്ഥിരത (എംഎസ്ഐ) (സ്റ്റാൻഡേർഡ് പാത്തോളജി പരിശോധനയ്ക്ക് പുറമേ) എന്നിവയെ മാത്രമേ ആശ്രയിക്കുന്നുള്ളൂ. കാൻസർ ജീനോം അറ്റ്ലസ് (ടിസിജിഎ) കൊളോറെക്ടൽ കാൻസർ കോഹോർട്ടിലും രോഗിയുടെ അതിജീവനത്തിലും ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള രോഗപ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ, സൂക്ഷ്മജീവ പ്രൊഫൈലുകൾ, ട്യൂമർ സ്ട്രോമ എന്നിവ തമ്മിലുള്ള ബന്ധമില്ലെന്ന് ഗവേഷകർ കണ്ടെത്തിയിട്ടുണ്ട്.

ഗവേഷണം പുരോഗമിക്കുന്നതിനനുസരിച്ച്, പ്രാഥമിക കൊളോറെക്ടൽ കാൻസറിന്റെ അളവ് സ്വഭാവസവിശേഷതകൾ, കാൻസർ സെല്ലുലാർ, ഇമ്മ്യൂൺ, സ്ട്രോമൽ അല്ലെങ്കിൽ സൂക്ഷ്മജീവി സ്വഭാവം എന്നിവ ക്ലിനിക്കൽ ഫലങ്ങളുമായി കാര്യമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നുവെന്ന് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെട്ടിട്ടുണ്ട്, എന്നാൽ അവയുടെ ഇടപെടലുകൾ രോഗിയുടെ ഫലങ്ങളെ എങ്ങനെ ബാധിക്കുന്നു എന്നതിനെക്കുറിച്ച് ഇപ്പോഴും പരിമിതമായ ധാരണയുണ്ട്.
ഫിനോടൈപ്പിക് സങ്കീർണ്ണതയും ഫലവും തമ്മിലുള്ള ബന്ധം വിശകലനം ചെയ്യുന്നതിനായി, ഖത്തറിലെ സിദ്ര ഇൻസ്റ്റിറ്റ്യൂട്ട് ഓഫ് മെഡിക്കൽ റിസർച്ചിലെ ഗവേഷകരുടെ ഒരു സംഘം അടുത്തിടെ ഒരു സംയോജിത സ്കോർ (mICRoScore) വികസിപ്പിച്ചെടുക്കുകയും സാധൂകരിക്കുകയും ചെയ്തു. മൈക്രോബയോം സ്വഭാവസവിശേഷതകളും രോഗപ്രതിരോധ നിരാകരണ സ്ഥിരാങ്കങ്ങളും (ICR) സംയോജിപ്പിച്ച് നല്ല അതിജീവന നിരക്കുള്ള ഒരു കൂട്ടം രോഗികളെ തിരിച്ചറിയുന്നു. പ്രൈമറി കൊളോറെക്ടൽ കാൻസർ ബാധിച്ച 348 രോഗികളിൽ നിന്നുള്ള ഫ്രഷ് ഫ്രോസൺ സാമ്പിളുകളുടെ സമഗ്രമായ ജീനോമിക് വിശകലനം സംഘം നടത്തി, അതിൽ ട്യൂമറുകളുടെയും പൊരുത്തപ്പെടുന്ന ആരോഗ്യകരമായ കൊളോറെക്ടൽ ടിഷ്യുവിന്റെയും RNA സീക്വൻസിംഗ്, മുഴുവൻ എക്സോം സീക്വൻസിംഗ്, ആഴത്തിലുള്ള ടി-സെൽ റിസപ്റ്റർ, 16S ബാക്ടീരിയൽ rRNA ജീൻ സീക്വൻസിംഗ് എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു, മൈക്രോബയോമിനെ കൂടുതൽ ചിത്രീകരിക്കുന്നതിന് മുഴുവൻ ട്യൂമർ ജീനോം സീക്വൻസിംഗ് അനുബന്ധമായി നൽകി. "വൻ ഇന്റഗ്രേറ്റഡ് ട്യൂമർ, ഇമ്മ്യൂൺ, മൈക്രോബയോം അറ്റ്ലസ് ഓഫ് കോളൻ കാൻസർ" എന്ന പേരിൽ നേച്ചർ മെഡിസിനിൽ ഈ പഠനം പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു.

നേച്ചർ മെഡിസിനിൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ച ലേഖനം

AC-ICAM അവലോകനം

സിസ്റ്റമിക് തെറാപ്പി ഇല്ലാതെ വൻകുടൽ കാൻസറിന്റെ ഹിസ്റ്റോളജിക്കൽ രോഗനിർണയമുള്ള രോഗികളിൽ നിന്ന് ഫ്രോസൺ ട്യൂമർ സാമ്പിളുകളും പൊരുത്തപ്പെടുത്തിയ തൊട്ടടുത്തുള്ള ആരോഗ്യകരമായ വൻകുടൽ ടിഷ്യുവും (ട്യൂമർ-നോർമൽ ജോഡികൾ) വിശകലനം ചെയ്യാൻ ഗവേഷകർ ഒരു ഓർത്തോഗണൽ ജീനോമിക് പ്ലാറ്റ്‌ഫോം ഉപയോഗിച്ചു. മുഴുവൻ-എക്‌സോം സീക്വൻസിംഗ് (WES), RNA-seq ഡാറ്റ ഗുണനിലവാര നിയന്ത്രണം, ഉൾപ്പെടുത്തൽ മാനദണ്ഡ സ്‌ക്രീനിംഗ് എന്നിവയെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, 348 രോഗികളിൽ നിന്നുള്ള ജീനോമിക് ഡാറ്റ നിലനിർത്തി 4.6 വർഷത്തെ ശരാശരി ഫോളോ-അപ്പ് ഉപയോഗിച്ച് ഡൗൺസ്ട്രീം വിശകലനത്തിനായി ഉപയോഗിച്ചു. ഗവേഷണ സംഘം ഈ വിഭവത്തിന് സിദ്ര-ലംക് എസി-ഐസിഎഎം: രോഗപ്രതിരോധ-കാൻസർ-മൈക്രോബയോം ഇടപെടലുകൾക്കുള്ള ഒരു ഭൂപടവും ഗൈഡും (ചിത്രം 1) എന്ന് പേരിട്ടു.

ICR ഉപയോഗിച്ചുള്ള തന്മാത്രാ വർഗ്ഗീകരണം

തുടർച്ചയായ കാൻസർ ഇമ്മ്യൂണോ സർവൈലൻസിനായി ഇമ്മ്യൂണൽ കോൺസ്റ്റന്റ് ഓഫ് റിജക്ഷൻ (ICR) എന്ന് വിളിക്കപ്പെടുന്ന ഒരു മോഡുലാർ ഇമ്മ്യൂണൽ ജനിതക മാർക്കറുകൾ പിടിച്ചെടുത്ത ഗവേഷണ സംഘം, മെലനോമ, ബ്ലാഡർ കാൻസർ, സ്തനാർബുദം എന്നിവയുൾപ്പെടെ വിവിധ തരം കാൻസർ രോഗികളെ ഉൾക്കൊള്ളുന്ന 20 ജീൻ പാനലിലേക്ക് ഘനീഭവിപ്പിച്ചുകൊണ്ട് ICR ഒപ്റ്റിമൈസ് ചെയ്തു. സ്തനാർബുദം ഉൾപ്പെടെ വിവിധ തരം കാൻസർ രോഗികളിൽ ഇമ്മ്യൂണോതെറാപ്പി പ്രതികരണവുമായും ICR ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു.

ആദ്യം, ഗവേഷകർ AC-ICAM കോഹോർട്ടിന്റെ ICR ഒപ്പ് സാധൂകരിച്ചു, ICR ജീൻ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സഹ-വർഗ്ഗീകരണ സമീപനം ഉപയോഗിച്ച് മൂന്ന് ക്ലസ്റ്ററുകൾ/ഇമ്മ്യൂൺ ഉപവിഭാഗങ്ങളായി കോഹോർട്ടിനെ തരംതിരിച്ചു: ഉയർന്ന ICR (ഹോട്ട് ട്യൂമറുകൾ), മീഡിയം ICR, ലോ ICR (കോൾഡ് ട്യൂമറുകൾ) (ചിത്രം 1b). വൻകുടൽ കാൻസറിന്റെ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള വർഗ്ഗീകരണമായ കൺസെൻസസ് മോളിക്യുലാർ സബ്‌ടൈപ്പുകളുമായി (CMS) ബന്ധപ്പെട്ട രോഗപ്രതിരോധ പ്രവണതയെ ഗവേഷകർ വിശേഷിപ്പിച്ചു. CMS വിഭാഗങ്ങളിൽ CMS1/ഇമ്മ്യൂൺ, CMS2/കാനോനിക്കൽ, CMS3/മെറ്റബോളിക്, CMS4/മെസെൻചൈമൽ എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു. എല്ലാ CMS ഉപവിഭാഗങ്ങളിലെയും ചില കാൻസർ സെൽ പാതകളുമായി ICR സ്കോറുകൾ നെഗറ്റീവ് ആയി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നുവെന്നും, രോഗപ്രതിരോധ ശേഷി കുറയ്ക്കുന്നതും സ്ട്രോമൽ സംബന്ധിയായതുമായ പാതകളുമായുള്ള പോസിറ്റീവ് പരസ്പര ബന്ധങ്ങൾ CMS4 ട്യൂമറുകളിൽ മാത്രമേ നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടിട്ടുള്ളൂവെന്നും വിശകലനം കാണിച്ചു.

എല്ലാ സിഎംഎസുകളിലും, പ്രകൃതിദത്ത കൊലയാളി (എൻകെ) സെല്ലുകളുടെയും ടി സെൽ സബ്‌സെറ്റുകളുടെയും സമൃദ്ധി ഐസിആർ ഉയർന്ന രോഗപ്രതിരോധ ഉപവിഭാഗങ്ങളിലാണ് ഏറ്റവും ഉയർന്നത്, മറ്റ് ല്യൂക്കോസൈറ്റ് ഉപവിഭാഗങ്ങളിൽ കൂടുതൽ വ്യതിയാനം ഉണ്ടായിരുന്നു (ചിത്രം 1സി). ഐസിആർ രോഗപ്രതിരോധ ഉപവിഭാഗങ്ങൾക്ക് വ്യത്യസ്ത OS, PFS എന്നിവ ഉണ്ടായിരുന്നു, താഴ്ന്നതിൽ നിന്ന് ഉയർന്നതിലേക്ക് ICR-ൽ ക്രമാനുഗതമായ വർദ്ധനവ് (ചിത്രം 1ഡി), ഇത് വൻകുടൽ കാൻസറിൽ ICR-ന്റെ പ്രോഗ്നോസ്റ്റിക് പങ്ക് സാധൂകരിക്കുന്നു.

ചിത്രം 1. AC-ICAM പഠന രൂപകൽപ്പന, രോഗപ്രതിരോധ സംബന്ധിയായ ജീൻ ഒപ്പ്, രോഗപ്രതിരോധ, തന്മാത്രാ ഉപവിഭാഗങ്ങൾ, അതിജീവനം.
ട്യൂമർ സമ്പുഷ്ടമായ, ക്ലോണലി ആംപ്ലിഫൈഡ് ചെയ്ത ടി കോശങ്ങളെ ICR പിടിച്ചെടുക്കുന്നു.
ട്യൂമർ ടിഷ്യുവിലേക്ക് നുഴഞ്ഞുകയറുന്ന ടി കോശങ്ങളുടെ ഒരു ന്യൂനപക്ഷം മാത്രമേ ട്യൂമർ ആന്റിജനുകൾക്ക് (10% ൽ താഴെ) പ്രത്യേകമായി കാണപ്പെടുന്നുള്ളൂ എന്ന് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെട്ടിട്ടുണ്ട്. അതിനാൽ, ഇൻട്രാ-ട്യൂമർ ടി കോശങ്ങളിൽ ഭൂരിഭാഗവും ബൈസ്റ്റാൻഡർ ടി സെല്ലുകൾ (ബൈസ്റ്റാൻഡർ ടി സെല്ലുകൾ) എന്നാണ് അറിയപ്പെടുന്നത്. ഉൽപ്പാദനക്ഷമമായ ടിസിആറുകളുള്ള പരമ്പരാഗത ടി സെല്ലുകളുടെ എണ്ണവുമായുള്ള ഏറ്റവും ശക്തമായ ബന്ധം സ്ട്രോമൽ സെല്ലിലും ല്യൂക്കോസൈറ്റ് സബ്പോപ്പുലേഷനുകളിലും (RNA-seq വഴി കണ്ടെത്തി) നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു, ഇത് ടി സെൽ സബ്പോപ്പുലേഷനുകൾ കണക്കാക്കാൻ ഉപയോഗിക്കാം (ചിത്രം 2a). ICR ക്ലസ്റ്ററുകളിൽ (മൊത്തത്തിലും CMS വർഗ്ഗീകരണത്തിലും), രോഗപ്രതിരോധ SEQ TCR-കളുടെ ഏറ്റവും ഉയർന്ന ക്ലോണാലിറ്റി ICR-ഉയർന്നതും CMS ഉപവിഭാഗവുമായ CMS1/ഇമ്മ്യൂൺ ഗ്രൂപ്പുകളിൽ (ചിത്രം 2c) നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു, ICR-ഉയർന്ന ട്യൂമറുകളുടെ ഏറ്റവും ഉയർന്ന അനുപാതം. മുഴുവൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമും (18,270 ജീനുകൾ) ഉപയോഗിച്ച്, ആറ് ICR ജീനുകൾ (IFNG, STAT1, IRF1, CCL5, GZMA, CXCL10) TCR ഇമ്മ്യൂൺ SEQ ക്ലോണാലിറ്റിയുമായി പോസിറ്റീവ് ആയി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന മികച്ച പത്ത് ജീനുകളിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു (ചിത്രം 2d). ട്യൂമർ-റെസ്പോൺസീവ് CD8+ മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ച് നിരീക്ഷിച്ച പരസ്പര ബന്ധങ്ങളെ അപേക്ഷിച്ച് ImmunoSEQ TCR ക്ലോണാലിറ്റി മിക്ക ICR ജീനുകളുമായും കൂടുതൽ ശക്തമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു (ചിത്രം 2f, 2g). ഉപസംഹാരമായി, മുകളിലുള്ള വിശകലനം സൂചിപ്പിക്കുന്നത് ICR സിഗ്നേച്ചർ ട്യൂമർ-സമ്പുഷ്ടമായ, ക്ലോണലി ആംപ്ലിഫൈഡ് ടി സെല്ലുകളുടെ സാന്നിധ്യം പിടിച്ചെടുക്കുന്നുവെന്നും അതിന്റെ പ്രോഗ്നോസ്റ്റിക് പ്രത്യാഘാതങ്ങൾ വിശദീകരിക്കാമെന്നുമാണ്.

ചിത്രം 2. ടിസിആർ മെട്രിക്സും രോഗപ്രതിരോധ സംബന്ധിയായ ജീനുകളുമായുള്ള പരസ്പര ബന്ധവും, രോഗപ്രതിരോധ, തന്മാത്രാ ഉപവിഭാഗങ്ങളും.
ആരോഗ്യമുള്ളതും വൻകുടൽ കാൻസർ കലകളിലുമുള്ള സൂക്ഷ്മജീവികളുടെ ഘടന.
246 രോഗികളിൽ നിന്ന് പൊരുത്തപ്പെടുന്ന ട്യൂമറിൽ നിന്നും ആരോഗ്യകരമായ വൻകുടൽ ടിഷ്യുവിൽ നിന്നും വേർതിരിച്ചെടുത്ത ഡിഎൻഎ ഉപയോഗിച്ച് ഗവേഷകർ 16S rRNA സീക്വൻസിംഗ് നടത്തി (ചിത്രം 3a). സാധൂകരണത്തിനായി, വിശകലനത്തിന് ലഭ്യമായ സാധാരണ ഡിഎൻഎയുമായി പൊരുത്തപ്പെടാത്ത 42 ട്യൂമർ സാമ്പിളുകളിൽ നിന്നുള്ള 16S rRNA ജീൻ സീക്വൻസിംഗ് ഡാറ്റയും ഗവേഷകർ വിശകലനം ചെയ്തു. ആദ്യം, പൊരുത്തപ്പെടുന്ന മുഴകൾക്കും ആരോഗ്യകരമായ വൻകുടൽ ടിഷ്യുവിനും ഇടയിലുള്ള സസ്യജാലങ്ങളുടെ ആപേക്ഷിക സമൃദ്ധിയെ ഗവേഷകർ താരതമ്യം ചെയ്തു. ആരോഗ്യകരമായ സാമ്പിളുകളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ ട്യൂമറുകളിൽ ക്ലോസ്ട്രിഡിയം പെർഫ്രിംഗൻസ് ഗണ്യമായി വർദ്ധിച്ചു (ചിത്രം 3a-3d). ട്യൂമറിനും ആരോഗ്യകരമായ സാമ്പിളുകൾക്കും ഇടയിൽ ആൽഫ വൈവിധ്യത്തിൽ (ഒറ്റ സാമ്പിളിലെ സ്പീഷിസുകളുടെ വൈവിധ്യവും സമൃദ്ധിയും) കാര്യമായ വ്യത്യാസമൊന്നുമില്ല, കൂടാതെ ICR-കുറഞ്ഞ മുഴകളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ ICR-ഉയർന്ന മുഴകളിൽ സൂക്ഷ്മജീവി വൈവിധ്യത്തിൽ നേരിയ കുറവ് കണ്ടെത്തി.
സൂക്ഷ്മജീവി പ്രൊഫൈലുകളും ക്ലിനിക്കൽ ഫലങ്ങളും തമ്മിലുള്ള ക്ലിനിക്കലി പ്രസക്തമായ ബന്ധങ്ങൾ കണ്ടെത്തുന്നതിന്, അതിജീവനം പ്രവചിക്കുന്ന സൂക്ഷ്മജീവി സവിശേഷതകൾ തിരിച്ചറിയാൻ 16S rRNA ജീൻ സീക്വൻസിംഗ് ഡാറ്റ ഉപയോഗിക്കാൻ ഗവേഷകർ ലക്ഷ്യമിട്ടു. AC-ICAM246-ൽ, MBR ക്ലാസിഫയറുകൾ എന്ന് വിളിക്കപ്പെടുന്ന പൂജ്യം അല്ലാത്ത ഗുണകങ്ങളുള്ള (ഡിഫറൻഷ്യൽ മരണ സാധ്യതയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട) 41 സവിശേഷതകൾ തിരഞ്ഞെടുത്ത ഒരു OS കോക്സ് റിഗ്രഷൻ മോഡൽ ഗവേഷകർ പ്രവർത്തിപ്പിച്ചു (ചിത്രം 3f).
ഈ പരിശീലന കൂട്ടായ്മയിൽ (ICAM246), കുറഞ്ഞ MBR സ്കോർ (MBR<0, കുറഞ്ഞ MBR) മരണസാധ്യത ഗണ്യമായി കുറയ്ക്കുന്നതുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു (85%). സ്വതന്ത്രമായി സാധുതയുള്ള രണ്ട് കൂട്ടായ്മകളിൽ (ICAM42, TCGA-COAD) കുറഞ്ഞ MBR (അപകടസാധ്യത) യും നീണ്ടുനിൽക്കുന്ന OS യും തമ്മിലുള്ള ബന്ധം ഗവേഷകർ സ്ഥിരീകരിച്ചു. (ചിത്രം 3) ട്യൂമറിലും ആരോഗ്യകരമായ വൻകുടൽ കലകളിലും സമാനമായ എൻഡോഗാസ്ട്രിക് കോക്കിയും MBR സ്കോറുകളും തമ്മിൽ ശക്തമായ ഒരു ബന്ധം പഠനം കാണിച്ചു, അവ.

ചിത്രം 3. ട്യൂമറിലും ആരോഗ്യകരമായ ടിഷ്യൂകളിലുമുള്ള മൈക്രോബയോമും ഐസിആറുമായുള്ള ബന്ധവും രോഗിയുടെ അതിജീവനവും.
തീരുമാനം
ഈ പഠനത്തിൽ ഉപയോഗിച്ചിരിക്കുന്ന മൾട്ടി-ഓമിക്സ് സമീപനം, വൻകുടൽ കാൻസറിലെ രോഗപ്രതിരോധ പ്രതികരണത്തിന്റെ തന്മാത്രാ ഒപ്പിന്റെ സമഗ്രമായ കണ്ടെത്തലും വിശകലനവും സാധ്യമാക്കുകയും മൈക്രോബയോമും രോഗപ്രതിരോധ സംവിധാനവും തമ്മിലുള്ള പ്രതിപ്രവർത്തനം വെളിപ്പെടുത്തുകയും ചെയ്യുന്നു. ട്യൂമറിന്റെയും ആരോഗ്യകരമായ ടിഷ്യൂകളുടെയും ആഴത്തിലുള്ള ടിസിആർ സീക്വൻസിംഗ്, ട്യൂമർ-സമ്പുഷ്ടവും ഒരുപക്ഷേ ട്യൂമർ ആന്റിജൻ-നിർദ്ദിഷ്ടവുമായ ടി സെൽ ക്ലോണുകൾ പിടിച്ചെടുക്കാനുള്ള കഴിവ് മൂലമാകാം ഐസിആറിന്റെ പ്രോഗ്നോസ്റ്റിക് പ്രഭാവം എന്ന് വെളിപ്പെടുത്തി.

AC-ICAM സാമ്പിളുകളിൽ 16S rRNA ജീൻ സീക്വൻസിംഗ് ഉപയോഗിച്ച് ട്യൂമർ മൈക്രോബയോം ഘടന വിശകലനം ചെയ്തുകൊണ്ട്, ശക്തമായ പ്രോഗ്നോസ്റ്റിക് മൂല്യമുള്ള ഒരു മൈക്രോബയോം സിഗ്നേച്ചർ (MBR റിസ്ക് സ്കോർ) സംഘം തിരിച്ചറിഞ്ഞു. ട്യൂമർ സാമ്പിളുകളിൽ നിന്നാണ് ഈ ഒപ്പ് ഉരുത്തിരിഞ്ഞതെങ്കിലും, ആരോഗ്യകരമായ കൊളോറെക്ടത്തിനും ട്യൂമർ MBR റിസ്ക് സ്കോറിനും ഇടയിൽ ശക്തമായ ഒരു ബന്ധമുണ്ടായിരുന്നു, ഇത് ഈ ഒപ്പിന് രോഗികളുടെ ഗട്ട് മൈക്രോബയോം ഘടന പിടിച്ചെടുക്കാൻ കഴിയുമെന്ന് സൂചിപ്പിക്കുന്നു. ICR, MBR സ്കോറുകൾ സംയോജിപ്പിക്കുന്നതിലൂടെ, കോളൻ കാൻസർ ബാധിച്ച രോഗികളിൽ അതിജീവനം പ്രവചിക്കുന്ന ഒരു മൾട്ടി-ഒമിക് സ്റ്റുഡന്റ് ബയോമാർക്കർ തിരിച്ചറിയാനും സാധൂകരിക്കാനും സാധിച്ചു. കോളൻ കാൻസർ ജീവശാസ്ത്രം നന്നായി മനസ്സിലാക്കുന്നതിനും വ്യക്തിഗതമാക്കിയ ചികിത്സാ സമീപനങ്ങൾ കണ്ടെത്തുന്നതിനും പഠനത്തിന്റെ മൾട്ടി-ഒമിക് ഡാറ്റാസെറ്റ് ഒരു ഉറവിടം നൽകുന്നു.

റഫറൻസ്:
Roelands, J., Kuppen, PJK, Ahmed, EI et al. വൻകുടൽ കാൻസറിൻ്റെ ഒരു സംയോജിത ട്യൂമർ, രോഗപ്രതിരോധം, മൈക്രോബയോം അറ്റ്ലസ്. നാറ്റ് മെഡ് 29, 1273–1286 (2023).